Hukukçu bir anne babanın evladı olarak 1964 yılında Kahramanmaraş’ta dünyaya geldi. Eğitimine Kahramanmaraş Atatürk İlkokulu’nda başladı. Ortaokulu Antakya Merkez Ortaokulu’nda, lise eğitimini Ankara Kocatepe Mimar Kemal Lisesi’nde tamamladı. Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi’nden 1987 yılında mezun oldu. Dr. Türkçapar, uzmanlık eğitimini mezun olduğu fakültenin Genel Cerrahi Kliniği’nde yaptı ve bu eğitimi 1992 yılında tamamladı. 1992 yılı Aralık ayında aynı üniversitede Uzman Doktor statüsünde çalışmaya başladı. Askerliğini 1993 yılında Ankara Mevki Hastanesinde yaptı. Ahmet Gökhan Türkçapar 24 Kasım 1997 yılında Üniversitelerarası Kurul’dan Doçent, 6 Nisan 2003 yılında Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi’nden Profesör unvanını aldı.
Dr. Türkçapar çalışmalarını mide cerrahisi ve reflü üzerine yoğunlaştırdı. Bu alanda deneyimini geliştirmek amacıyla yurt dışındaki kliniklerde bulundu. Bunlardan bazıları şunlardır: Eurepean Surgical Institude (Hamburg ) 1998 Laparoskopik Cerrahi; Morbid obezite cerrahisi (Brüksel – 2000) Dr. M. Vertruyen; Güney Kaliforniya Üniversitesi – Endoskopik girişim kursu (Mayıs 2001); Dr.Karl Miller – Laparoskopik obezite cerrahisi (Salzburg 2006) ve ECE-Bariatrik cerrahi-(Paris 2006).
Dr. Ahmet Türkçapar, Ankara Üniversitesi’nde çok sayıda öğrenci yetiştirmenin yanı sıra birçok bilimsel makale yayınladı. Özellikle obezite alanında yaptığı çalışmalarla Türkiye’de ve dünyada tanınan bir isim hâline geldi. Prof. Türkçapar, kalp, şeker gibi toplum sağlığını tehdit eden hastalıkların temelinde obezite olduğu konusundaki tezini çeşitli platformlarda halka anlatmaya çalıştı. Toplum sağlığını tehdit eden en önemli hastalığın şişmanlık ve bunun sebepleri olduğunu dile getiren doktor olarak tanındı. Kendisi “Türkçapar Bariatrics’i kurdu ve Acıbadem Fulya Hastanesi’yle birlikte IFSO’nun (Uluslararası Obezite Cerrahisi Federasyonu) 2 yıllık takibi sonrasında ‘Mükemmeliyet Merkezi’ yani ‘Center of Exellence’ sertifikasını aldı.
Dr. Türkçapar; Ulusal Cerrahi Derneği, Ankara Cerrahi Derneği, Laparoskopik Cerrahi Derneği, Türk Gastroenteroloji Derneği, Fıtık Derneği, International College of Surgeons, Surgical Infection Society, International Association of Surgeons and Gastroenterologist, International Federation for the Surgery of Obesity and metabolic disorders.(IFSO), American Society for Metabolic &Bariatric Surgery.(ASMBS) gibi alanıyla ilgili ulusal ve uluslararası sivil toplum derneklerine üyedir.
Prof. Dr. Ahmet Gökhan Türkçapar Türkiye Klinikleri Cerrahi Dergisinin editörlüğünü yapmaktadır. Yabancı dili İngilizcedir. Evli ve üç kız çocuğu babasıdır.